二千円札が定着しなかった最大の理由は、紙幣そのものが悪かったというより、使うための環境が整う前に発行されたことです

機械が対応しなかった
二千円札が発行された2000年当時は、ATM・自動販売機・券売機・レジの紙幣識別機がすでに広く普及していました。

そのため、新しい二千円札に対応するには機械の改修が必要でしたが、発行までの準備期間が十分ではありませんでした。日銀も、二千円札が普及しなかった理由として「機械がかなり普及した後に登場したこと」を挙げています。

特に飲料・たばこの自動販売機では対応が進まず、「持っていても使えないかもしれない」という印象が広まりました

必要性が弱かった
日本ではすでに、

1,000円札
5,000円札
10,000円札
が定着しており、日常の支払いはこの3種類でほぼ足りました。

二千円札は、たとえば4,000円の支払いに便利ではありますが、1,000円札2枚でも済みます。つまり、便利そうではあるものの、「わざわざ必要」と思わせるほどの差がありませんでした

流通の循環が生まれなかった
紙幣は、ATMから出て、店で使われ、店から銀行へ戻り、再びATMなどから出ることで定着します。

しかし二千円札は、ATMから出てこない、レジや機械で使えない、銀行に戻ると再び出金されにくい、という流れになりました。

その結果、2003年ごろに約5億枚まで増えた流通枚数は、その後減少しました

発行の経緯も影響した
二千円札は、2000年7月19日、九州・沖縄サミットや新千年紀を記念する意味合いもあって発行されました。

ただし、構想から発行までの期間が短く、金融機関や民間の機械が十分に準備できなかったとされています。日銀は後年、二千円札について「十分な準備が必要だった」という教訓を示しています

沖縄では比較的定着
全国ではあまり見かけませんが、沖縄では例外的に流通しています。

守礼門が描かれているため親しみがあり、ATMで二千円札を優先して出す仕組みを導入した金融機関もあります。そのため、沖縄では現在でも本土より目にする機会があります