さらに経営陣との確執もあって学長と副学長が辞任。「強固なムラ社会の意識」を排除し、ガバナンスの抜本的な見直しなどを約束する改善計画を文部科学省に提出し、大学改革に当たってきた。

　学内関係者によると、林氏の続投を求める声もあったが、本人が退任を申し出たという