ホオダレムクドリの絶滅の原因はヨーロッパからの移民による羽根目的の乱獲や農業用の牧草地を作る為の森林破壊、オコジョやキツネなどの動物を移入してしまった事などが主な絶滅の原因となったとされています。絶滅年は1907年12月28日だと言われています。
雌雄のクチバシの形状の違いによってオスとメスで協力して別の餌を採って生き抜いてきたされるホオダレムクドリですが移民達が与えた多くの試練には打ち勝つ事はできませんでした